面對(duì)重癥感染患者，能否快速確認(rèn)感染性疾病原體，成為后續(xù)對(duì)癥治療的關(guān)鍵。傳統(tǒng)的微生物鑒定方法分為培養(yǎng)和非培養(yǎng)兩類，臨床公認(rèn)的“金標(biāo)準(zhǔn)”是分離培養(yǎng)和生化鑒定，這種方法的操作周期長、失敗率高，并且不是每種病原體都可以培養(yǎng)。不依賴培養(yǎng)的方法比如涂片鏡檢、抗體抗原免疫等，在采樣當(dāng)天即可報(bào)告結(jié)果。這些方法的時(shí)效性強(qiáng)，但在敏感性和特異性上存在較明顯的劣勢(shì)，而且傳統(tǒng)的微生物鑒定方法對(duì)于未知或者罕見的病原微生物，無法快速識(shí)別。
而mNGS不依賴于傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng)，也無需特異性擴(kuò)增，直接對(duì)臨床樣本中的核酸進(jìn)行無差別、無選擇性的高通量測(cè)序，然后與已知的微生物序列數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì)分析，根據(jù)比對(duì)到的序列信息來判斷樣本包含的病原微生物種類，能夠快速、客觀地檢測(cè)臨床樣本中的病原微生物（包括病毒、細(xì)菌、真菌、寄生蟲）
目前已經(jīng)有數(shù)十篇mNGS專家共識(shí)中提到，對(duì)于一些危重癥感染患者，建議留取合適的標(biāo)本，進(jìn)行mNGS檢測(cè)，更快更精準(zhǔn)的幫助臨床找到感染性疾病原體，從而精準(zhǔn)使用抗生素。