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宏基因組測序

宏基因組測序(Metagenomics Sequencing)是對環(huán)境樣品中的微生物群落的基因組進(jìn)行高通量測序,主要研究微生物種群結(jié)構(gòu)、基因功能活性、微生物之間的相互協(xié)作關(guān)系以及微生物與環(huán)境之間的關(guān)系。宏基因組測序研究擺脫了微生物分離純培養(yǎng)的限制,擴(kuò)展了微生物資源的利用空間,為環(huán)境微生物群落的研究提供了有效工具。

宏基因組測序

宏基因組測序(Metagenomics Sequencing)是對環(huán)境樣品中的微生物群落的基因組進(jìn)行高通量測序,主要研究微生物種群結(jié)構(gòu)、基因功能活性、微生物之間的相互協(xié)作關(guān)系以及微生物與環(huán)境之間的關(guān)系。宏基因組測序研究擺脫了微生物分離純培養(yǎng)的限制,擴(kuò)展了微生物資源的利用空間,為環(huán)境微生物群落的研究提供了有效工具。

技術(shù)優(yōu)勢

直接對特定環(huán)境中全部微生物群體基因組進(jìn)行測序。環(huán)境微生物通常以群落方式共存和互作,宏基因組研究比單個個體研究更能反映微生物的真實生存狀態(tài)。除分析微生物群體多樣性和豐度外,還可以解析微生物基因功能和參與的代謝通路,發(fā)掘新的具有特定功能的基因。

技術(shù)路線
分析內(nèi)容
樣本類型
  • 環(huán)境樣品,總DNA等

  • 建議總DNA起始量:5 μg,最低0.5 μg,濃度≥30 ng/μL(Qubit定量)

常規(guī)項目周期
  • 35個工作日

參考文獻(xiàn)
  • Campbell J D, Alexandrov A, Kim J, et al. Distinct patterns of somatic genome alterations in lung adeno-carcinomas and squamous cell carcinomas[J]. Nature Genetics, 2016, 48(6):607.

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